Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms