Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Shisa9Q9CZN4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms