Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis18aQ9CZJ6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms