Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms