Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ChtopQ9CY57 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms