Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cnih4Q9CX13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cnih4Q9CX13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnih4Q9CX13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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