Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn1Q9CWM4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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