Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sycp2Q9CUU3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms