Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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