Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms