Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms