Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms