Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim8Q9CQQ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms