Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccer1Q9CQL2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms