Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms