Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsnaxip1Q99P25 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms