Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NsmfQ99NF2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms