Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brms1Q99N20 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brms1Q99N20 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms