Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ms4a8Q99N10 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a8Q99N10 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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