Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf2Q99LE6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms