Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lactb2Q99KR3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms