Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms