Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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