Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tom1l1Q923U0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms