Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms