Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn1Q922Y1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn1Q922Y1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms