Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms