Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atpaf2Q91YY4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms