Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atl3Q91YH5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms