Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps36Q91XD6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms