Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms