Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col26a1Q91VF6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms