Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms