Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul7Q8VE73 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms