Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx18Q8VDS8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms