Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttc8Q8VD72 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttc8Q8VD72 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc8Q8VD72 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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