Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnajc28Q8VCE1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms