Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cops8Q8VBV7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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