Protein–RNA interactions for Protein: Q8R311

Ctage5, Endoplasmic reticulum export factor CTAGE5, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctage5Q8R311 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctage5Q8R311 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctage5Q8R311 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms