Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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