Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Impg1Q8R1W8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Impg1Q8R1W8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Impg1Q8R1W8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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