Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sf3b4Q8QZY9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sf3b4Q8QZY9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms