Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxc12Q8K5B8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxc12Q8K5B8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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