Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin28aQ8K3Y3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms