Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot6Q8K3P5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnot6Q8K3P5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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