Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms