Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms