Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms