Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms