Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms